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我國3000份綠色超級稻基因組原始測序數據從“云端”向全球共享

日期:2015年9月21日 20:19

  9月15日,中國農業科學院、阿里云計算有限公司、華智水稻生物技術有限公司、北京聚道科技有限公司在長沙共同啟動“云之稻項目”,3000份綠色超級稻基因組原始測序數據,將正式通過阿里云平臺,向全球免費開放。這不僅有利于加快規模化發掘水稻優良基因,突破水稻復雜性狀分子改良的技術瓶頸,還能加快高產、優質、廣適性新品種培育的進程,全面提升我國及全球水稻基因組研究和分子育種水平。
  來源于全球89個國家的3000份水稻核心種質基因組測序數據,是科技部和比爾·梅琳達蓋茨基金會“為非洲和亞洲資源貧瘠地區培育綠色超級稻”重大科技專項的重要課題成果,這也是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項目。項目旨在培育能夠廣泛適用于灌溉和雨養地區生態環境,并具氮磷高效利用、抗病、抗蟲、高產、優質、抗逆(干旱、鹽堿)等特性的水稻新品種,在目標國示范推廣,推動雜交稻種子生產能力,并為撒哈拉以南非洲國家、亞洲和中國的西南地區水稻分子育種建立一個高效水稻基因型分析技術平臺。
  為水稻核心種質做基因組測序,是一項龐大工程。該基因數據庫資源,至少有兩方面用途,一是從基因庫調取數據,研究目標基因的分布、進化和功能。二是可分析基因組之間的多態性位點,并以之開發分子標記,甚至是基因芯片,用于分子育種。通過對3000份水稻核心種質基因組測序分析,能夠回答水稻有多少遺傳多樣性可以應用,從哪里獲取生物育種所需遺傳資源的問題,分析得到的數據將為水稻基礎認識和生物育種提供基礎信息資源。這項研究可揭示全球栽培稻資源的基因組多樣性,和每個水稻資源的遺傳特點及應用價值。此外,將3000份水稻種質資源帶入水稻育種應用中,將為水稻育種創新提供材料和新思路,對數據的分析結果還將填補人們對水稻甚至各個物種在基因組學方面的知識空缺。
  據專家介紹,當水稻基因組研究碰上“云計算”將會產生極大的魔力。比如說,剛退出的“兩優0293”品種的不足之處就是稻瘟病的抗性比較差,而3000分水稻基因組研究將借助于“云之稻”項目,在3年內,將不僅能找到更多的抗病基因,而且有望讓新品種稻瘟病的抗性提高到3級以上,從而培育產量、抗性等相對全面的水稻新品種,促使超級稻品種的適應性更好、更廣。

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